كنيسة القديس نيقولا (بالألمانية: St.-Nikolai-Kirche) هي كنيسة قديمة مهدمة تقع في هامبورغ في ألمانيا. يبلغ طول برجها 147 متر، لتعد بذلك ثالث أطول كنيسة في ألمانيا.
يعود تاريخ الكنيسة إلى عام 1195، تم توسعتها و تحديثها في القرون الثالثة و الرابعة عشرة. حرقت معظم مباني الكنيسة في حريق عام 1842، الذي اندلع في معظم أجزاء هامبورغ حينها. تم إعادة بناء الكنيسة على حسب خطط معمارية من مهندس انغليزي بين الأعوام 1846 - 1863. تم إلحاق برج الكنيسة بالكنيسة عام 1874. دمرت كنيسة القديس نيقولا بين أعوام 1943 و 1944 في الحرب العالمية الثانية من خلال قصف قوات الحلفاء لمدينة هامبورغ و خاصة الطائرات البريطانية منها. بقي فقط البرج معافى من الخسائر. تخلت الحكومة الألمانية عن فكرة إعادة بناء الكنيسية، وجعلت من الموقع و الأنقاض تذكارا لضحايا الحرب من جميع الأطراف. تم إضافة 51 جرس جديد للبرج عام 1993. .