ميناء هامبورغ (بالألمانية: Hamburger Hafen) هو أكبر ميناء في ألمانيا و ثاني أكبر ميناء في أوروبا و أحد أكبر تسع موانئ الحاويات في العالم. بالرغم من أن مدينة هامبورغ لا تقع مباشرة على البحر، و إنما وجودها على نهر الإلبه، العريض نسبيا و الصالح للملاحة، و قربها من بحر الشمال، مهد لها أن تصير من أكبر الموانئ. يقع الميناء في وسط المدينة على بعد 110 كم من مصب النهر في بحر الشمال. في عام 2004، تم إفراغ وتحميل 7 ملايين حاوية. الميناء هو الأول عالميا في تحميل البن.
11700 سفينة دخلت الميناء عام 2002. هناك مصاف ل 320 سفينة، منها مصاف ل 38 سفينة حاويات و سفن شحن كبيرة. هناك خطط لعمل أرصفة أخرى تسع لتسع سفن حاويات أخرى. هناك سفن حفر تعمل طوال العام لتأمين عمق 13 متر من النهر لدخول السفن، وخاصة الكبيرة منهم. مع أن الميناء يقع مسافة ليست بالقليلة في عمق الأراضي الألمانية (110 كم)، إلا أنه لا يجب على المرء عدم نسيان رخص النقل البحري مقارنة مع النقل البري للبضائع حين توصيلها لهامبورغ من ساحل بحر الشمال. المنطقة الحرة في الميناء هي أحد مزاياه أيضا. البضائع التي تأتي مع السفن، لا يتم جمركتها إلا عند دخولها للأراضي الألمانية. يمكن أن يتم إعادة تصديرها إلى الخارج بدون أن تتم جمركتها. المنطقة الحرة مسيجة و يوجد نقاط تفتيش جمركية على مداخلها و مخارجها. لهذا الغرض، تم بناء مدينة التخزين داخل حدود المنطقة الحرة.