علم جزر القمر الحالي تم تبنيه سنة 2003 . الأعلام السابقة كانت تتألف من الهلال الإسلامي بشكل رئيسي على حقل أخضر . التصميم الجديد يذكر بالهلال الإسلامي مع الأخذ بعين الإعتبار وضع الهلال على حقل أخضر . بالإضافة إلى ذلك ، فقد تم إدراج أربعة مستطيلات جديدة لتمثيل الأربعة جزر التي تكون جمهورية جزر القمر ، و الألوان هي :
بالنسبة للنجوم الأربع ، فهي تمثل أيضاً الأربعة جزر الرئيسية في البلد ، بينما الهلال يمثل الإسلام ، الدين الذي يتبعه أغلبية سكان جزر القمر . العلم له تشابه كبير مع علم جبل الدروز .