سجـن وادي النطرون هو تسمية لاثنين من السجون المصرية، يقعان على الطريق الصحراوي بين القاهرة والإسكندرية:
- ويقع أولهما في مستوى الكلم 92 وقد تم الفراغ من بنائه في سبتمبر/أيلول 1994 ، ونقل إليه المعتقلين من سجن استقبال طره وأبي زعبل الصناعي . وبه ثلاثة عنابر بها ما مجموعه 54 زنزانة جميعها للمعتقلين السياسيين.
- ويقع الثاني في مستوى الكلم 97. ويتكون من سبعة عنابر من بينها 4 عنابر مخصصة للسجناء والمعتقلين السياسيين الذين يبلغ عددهم حوالي 1400 وبقية العنابر للسجناء الجنائيين الذين يبلغ عددهم 1100 سجين جنائي .