تقع منابع العوجا في رأس العين حيث تتدفق هناك المياه من باطن الارض من خلال ما يقارب 2000 عين ماء وكميه المياه التي تعطيها مجموعة العيون هذه غير ثابته فهي تصل في الشتاء حتى 15 مليون م مكعب من هنا فان نهر العوجا دائم الجريان طيلة ايام السنه ومياهه نقيه جدا فيها اسماك وكائنات حية اخرى وكانت مستغله للشرب ولارواء المزارع والبيارات الممتده على طول النهر .
في سنة 1934\1935 قامت سلطات الانتداب البريطاني بمد انبوب بطول 60 كم وذلك من منابع نهر العوجا الواقعه في رأس العين وحتى مدينة القدس التي كانت في حينه بأمس الحاجه للمياه وقد قامت القوات العراقيه التي تواجدت في منطقه رأس العين في سنة 1948 بتفجير مضخات هذا المشروع فتعطلت عن العمل . وفي سنة 1952 اقيم مشروع "اليركون-النقب"الذي ضخ مياه منابع العوجا إلى النقب الشمالي لارواء سكانه واراضيه ،وفي شهر حزيران 1964 انجز العمل في المشروع القطري نهائيا ،حيث ضخت مياه بحيرة طبريا على طول 130 كم حتى رأس العين ،ومن هناك ربط هذا المشروع بمشروع "اليركون-النقب" ومنذ ذلك الحين تغيرت معالم نهر ا لعوجا بصوره حاده من حيث نباتاته واحيائه وعلى الاخص جودة مياهه.
واكبر الوديان التي تصب في نهر العوجا هو وادي المصراره. قبل استغلال مياه نهر العوجا كانت المياه تتدفق فيه من منابعه في رأس العين الواقعه على ارتفاع 16 متر فوق سطح البحر باتجاه البحر الابيض المتوسط ،بخط جوي طوله 14 كم ،في حين ان طول مجرى النهر على الارض هو 26-27كم وذلك بسبب التعرجات المتعدده للنهر ومن هنا اسمه "نهر العوجا" اما اليركون فهو اسم عبري "اليركون" ومصدره من التوراه.
وادي اليركون عباره عن 1800 كم مكعب ويوصله مياه من ثلاث روافد وهي :
- وادي الاشقر(قانا):مساحة حوضه 240 كم مربع بدايته في المنطقه الواقعه جنوب نابلس وشرق جبل جرزيم وهو يخرج من الجبال إلى السهل في المنطقه الواقعه جنوب شرق كفار سابا ويصب في العوجا غربي شارع بيتح تكفا-هود هشرون .
- وادي دير بلوط (شيلون) : مساحة حوضه 400 كم مربع ويخرج من الجبال إلى السهل جنوب مجدل صادق ويصب في العوجا 4كم غربي شارع بيتح تكفا وذلك في منطقه هود هشرون (مقابل مصب وادي الاشقر تقريبا)والجزء السفلي من هذا الواد ملوث جدا ويعد من مصادر التلوث الرئيسيه للعوجا حيث يسيل اليه من المستوطنات الواقعه على ضفته الجنوبيه مجاري كثيره .
- وادي المصراره (ايلون): مساحة حوضه 805 كم مربع وروافده العليا تمتد في جبال القدس ورام الله وهو يصب في العوجا على بعد 3 كم قبل مصبه في البحر .
يقسم نهر اليركون إلى ثلاث اقسام:
- القسم الاعلى :وفي هذا القسم تكون المياه خاليه من الملوثات وطوله
7 كم.
- القسم الاوسط :وفي هذا القسم يوجد تلوث حيث سمي ب-"اليركون الملوث"وطوله 16 كم.
- القسم الاسفل:وهذا القسم اطلق عليه "اليركون المالح"وطوله 4 كم.