في الحوسبة، نظام الملفات (أيضاً file system, filesystem) يعنى طريقة تخزين وتنظيم وإدارة ملفات الحاسوب والبيانات التى تحتوى عليها تلك الملفات لتسهيل إيجادهم ودخولهم. أنظمة الملفات قد تستعمل أداة لتخزين البيانات مثل القرص الصلب أو قرص الذاكرة المدمج.