الميكروبات Microbes أو الجراثيم "Germs" هي مجموعة من الكائنات الحية الدقيقة التي لا تُرى بالعين المجردة إلّا أن هناك شواذ لهذه القاعدة فالبعض منها يمكن رؤيته بالعين المجردة. العلم الذي يختص بدراسة الكائنات الحية الدقيقة يسمى علم الأحياء الدقيقة. الكائنات الدقيقة تشمل البكتيريا، الفطريات، الطحالب وأوليات النواة ولكنها لا تشمل الفيروسات، والتي تُصنف عادة ككائنات غير حية بينما تكون معظم الكائنات الدقيقة وحيد الخلية.
تعيش الكائنات الدقيقة تقريبا في كل مكان على سطح الأرض حيث يوجد الماء بصورة سائلة. وهذا يشمل حتّى الينابيع الساخنة، قيعان المحيطات وداخل الصخور التي تكون القشرة الأرضية. الكائنات الدقيقة حيوية بالنسبة للسلسلة الغذائية في المحيط الحيوي حيث أنها تعمل كمحللات. وكما أن البعض منها له القدرة على تثبيت النيتروجين؛ فهي مهمة بالنسبة لدورة النيتروجين، ومع ذلك فالبعض منها مُمرض حيث يهاجم الكائنات الحية الاخرى ويكون سببا في المرض الذي يؤدي لوفات الملايين من الناس كل عام.