مصفوفة دنا صغيرة (بالإنجليزية: DNA Microarray) هي تقنية جزيئية يتم استخدامها في الأبحاث العلمية لعدة أغراض كدراسة التعبير الجيني، أو دراسة تأثير دواء ما على المرضى و غيرها العديد من التطبيقات. يتم عرض نتائج الفحص على شكل مصفوفات دقيقة مضاءة بألوان مختلفة حسب التهجين.
مبدأ هذه التقنية يعتمد على عملية التهجين بين المادة (الدنا) المراد دراستها مع آلاف الجينات الموجودة على رقاقة زجاجية أو بلاستيكية صغيرة تسمى برقاقة الدنا. تحوي هذه الرقاقة على العديد من قطع الدنا تعرف باسم مسابر الدنا. هذه المسابر ماهي إلا عبارة عن تسلسل معروف و معين من النيوكليوتيدات و يمثل جزء من مورثة معينة.