محمد مرسي عضو مكتب الارشاد بجماعة الإخوان المسلمين وأحد القيادات السياسية بالجماعة، له علاقاته المتميزة بجميع القوى السياسية. انتخب عام 2000 عضوا بمجلس الشعب عن جماعة الاخوان وشغل موقع المتحدث الرسمى باسم الكتلة البرلمانية للاخوان. وفى اخر انتخابات لمجلس الشعب 2005 حصل على أعلى الأصوات وبفارق كبير عن أقرب منافسيه ولكن النظام تآمر عليه وأَعلن فوز منافسه.
كان من أنشط اعضاء مجلس الشعب على الاطلاق وكان صاحب أشهر استجواب في مجلس الشعب عن حادثة قطار الصعيد وأدان الحكومة وخرجت الصحف الحكومية في اليوم التالى تشيد باستجوابه