سلطنة جوهر (بالملاوية: Kesultanan Johor) كانت سلطنة أسّسها ابن سلطان سلطنة مالاكا محمود شاه، وهو السلطان علاء الدين ريات شاه في 1528. جوهر كان جزء من سلطنة مالاكا قبل الفتح البرتغالي لعاصمة مالاكا في 1511. سيطرت السلطنة على جوهر دار التعظيم المعاصرة، ورياو، والأجزاء في جنوب شرق سومطرة. في 1946، أصبحت جزء من الإتحاد الملاوي. وبعد سنتين، إنضمّت إلى اتحاد مالايا، وبعد ذلك إلى اتحاد ماليزيا في 1963.
في 1511، سقطت مالاكا على أيدي البرتغاليين وأجبر السلطان محمود شاه على الهروب من مالاكا. حاول السلطان عدّة مرات لإعادة العاصمة ولكن جهوده كانت غير مثمرة. البرتغاليون إنتقموا وأجبروا السلطان على الهروب إلى بهنج دار المعمور. لاحقا، أبحر السلطان إلى بنتان وأسّس عاصمة جديدة هناك. مع تأسيس قاعدة، حشّد السلطان القوات الملاوية المشوّشة ونظّم عدّة هجمات وحالات حصار ضدّ الموقع البرتغالي.
الهجمات المتكرّرة على مالاكا سبّبت المشقّة الحادّة للبرتغاليين وهي ساعدت على إقناع البرتغاليين لتحطيم قوات سلطان المنفية. أجري عدد من المحاولات لقمع الملاويين، حتى عام 1526 حين هدّم البرتغاليين بنتان أخيرا وسوها بالأرض. تراجع السلطان بعد ذلك إلى كامبار في سومطرة ومات بعد سنتين، تاركاً وراؤه إبنين هما مظفر شاه وعلاء الدين ريات شاه.
مظفر شاه إستمرّ بتأسيس براق دار الرضوان بينما أصبح علاء الدين ريات شاه السلطان الأول لجوهر.