كانت خور مكسر تابعة لحكم السلطنة الفضلية وبعد ان احتل البريطانيون عدن تم قتل الكثير من أبناء وسلاطين الفضلي والكثير من أبناء الجنوب الذين كانوا يدافعوا عن حريتهم وسميت خور مكسر نسباً إلى السطان أحمد بن عبدالله الفضلي والذي كان يلقب بالمكسر بشد السين وقد كانت قبيلته تمتلك هذه المنطقه إلى باب السلب (باب حديد حالياً).