جامعة سوهاج من الجامعات الإقليمية الوليدة هدفها الاستراتيجيى العام هو تغطية احتياجات سوق العمل المحلى والقومى والإقليمى من الخريجين المؤهلين علمياً وعملياً وكذلك إعداد جيل من العلماء المتميزين القادرين على قيادة عجلة التنمية في كافة المجالات الإنسانية والاجتماعية والعلوم الإنسانية والتطبيقية.
تم إنشاء أول كلية بجامعة سوهاج وهي كلية التربية سنة 1971 وكانت في ذلك الوقت تابعة لجامعة أسيوط، ثم لجامعة جنوب الوادي، ثم توالى إنشاء الكليات حتى صار عددها اليوم 10 كليات هي:-
1. كلية الطب. 2. كلية العلوم. 3. كلية التربية. 4. كلية الآداب. 5. كلية التجارة. 6. كلية الزراعة. وجميع هذه الكليات كانت موجودة قبل استقلال جامعة سوهاج
بينما هذه الكليات أنشئت بعد استقلال الجامعة 7. كلية التمريض. 8. كلية التعليم الصناعي.
اما هذه الكليات فقد صدر بها القرار الجمهوري سنة 2007 بإنشائها ولكن لم تبدأ الدراسة بها بعد: 9. كلية الطب البيطري. 10. كلية الهندسة.
وقد انفصلت الجامعة رسمياً عن جامعة جنوب الوادي سنة 2006، وأصبح السيد الأستاذ الدكتور/ مصطفى محمد كمال أول رئيس للجامعة.