ولدت فكرة إنشاء اتحاد إسلامي عالمي للمنظمات الطلابية في اللقاء الذي دعت إليه جمعية الطلبة المسلمين في نيجيريا في يوليو عام 1966 (بجامعة إبادن). حضرت اللقاء الجمعيات الطلابية في كل من السودان، نيجيريا، سيراليون، غامبيا، غانا، غينيا. انبثقت عن اللقاء لجنة تحضيرية تعدّ لعقد مؤتمر عالمي طلابي.
عقد الاجتماع في ديسمبر 1966 في السودان، وحضرته وفود من:
اتحاد الطلبة المسلمين في أوروبا،
واتحاد الطلبة المسلمين في أمريكا وكندا،
واتحاد طلاب جامعة أم درمان الإسلامية،
وجمعية الطلبة المسلمين في نيجيريا،
واتحاد عام الطلاب المسلمين التشاديين،
واتحاد عام الطلاب الأرتيريين.
أسفر الاجتماع عن وضع مسودة الدستور.
في موسم حج عام 1387-1388هـ الموافق شباط (فبراير) 1968م، تم عقد اجتماع ضم:
اتحاد الطلبة المسلمين في أمريكا وكندا،
واتحاد الطلبة المسلمين في أوروبا،
واتحاد الطلبة المسلمين بجامعة أم درمان الإسلامية،
واتحاد الطلبة المسلمين بالمملكة المتحدة وايرلندا.
عقد المؤتمر التأسيسي للاتحاد في المركز الإسلامي في (آخن) في ألمانيا الغربية.