اضطهاد المسلمين ظاهرة الاضطهاد غير المبررة يمكن ان تشير إلى الاعتقال والسجن ، والضرب ، والتعذيب ، او الاعدام. كما انه قد يشير إلى مصادرة او تدمير للممتلكات ، أو التحريض على كراهيه المسلمين. الاضطهاد يمكن ان تمتد إلى ما وراء اولئك الذين يعتبرون أنفسهم مسلمين لتشمل اولئك الذين ينظر بها آخرون ليسوا من المسلمين ، او على المسلمين التي يعتبرهم المسلمين غير مسلمين.
في الأيام الأولى من الاسلام في مكة ، كثيرا ما تعرض المسلمين الجدد لسوء المعامله والاضطهاد. بعض قتلوا ، أو تعرض للتعذيب بلال بن رباح (الذي سيصبح أول مؤذن) اخرج إلى الصحراء في حرارة منتصف النهار ووضع الصخور الثقيلة على صدره ، وقال انه يطالب بأن يتخلى عن دينه و يصلي إلى الآلهة .
المادة الرئيسية : الحروب الصليبية
كانت الحملة الصليبية الاولى التي بدأت في 1095 من قبل البابا اوربان الثاني مع ذكر لاستعادة السيطرة على المدينة المقدسة في القدس والاراضي المقدسة من المسلمين الذين استولوا عليها من الإمبراطورية البيزنطية في 638 وجزئيا ردا على الجدل الذى تقلد أهم الصراع بين القوى العلمانية والدينية في أوروبا في القرون الوسطى. كما انها بدأت نزاع بين الامبراطور الروماني المقدس و البابويه الغريغوريه وأدت إلى مفهوم سياسي للمسيحية بوصفها اتحاد جميع الشعوب والملوك بتوجيه من البابا .
اسفرت الحملة الاولى عن احتلال القدس في 7 ايار عام 1099 وقيام مملكة القدس اللاتينية بالاضافة إلى عدّة مناطق حكم صليبية اخرى ،كالرها(اديسا) وامارة انطاكية وطرابلس بالشام.
في 15 تموز / يوليو الحالي ، تمكن الصليبيين من انهاء الحصار على طريق تحطيم الابواب والجدران من دخول المدينة. وعلى مدار تلك العشيه ، مساء وصباح اليوم التالي ، قتل الصليبيون تقريبا كل فرد من سكان القدس مسلمين ويهود ، وحتى المسيحيين الشرقييين كانوا يذبحون جميعا. ورغم ان العديد من المسلمين يطلبون المأوى على قمة جبل الهيكل داخل المسجد الاقصى ، الصليبيون يدخر ارواح قليلة. ووفقا لغفل gesta francorum ، في ما يعتقد البعض انه واحد من أثمن المصادر المعاصرة من أول حملة صليبيه ، " ذبح كان كبيرا لدرجة ان رجالنا في مخاض الدم يصل إلى الكواحل..." حسابات أخرى من الدم يتدفق ما يصل إلى الجمه من الخيول تمثل تجسيدا لعبره من رؤيا يوحنا (14:20).
وفقا لfulcher من مدينة تشارتريز : "في الواقع ، اذا كان هناك لكم انكم سوف شهدت اقدامنا الملونة لدينا الكواحل مع دماء من قتلت. ولكن أكثر ما يكون لي ان تتصل؟ احدا من هؤلاء لم يترك حيا ؛ لا النساء ولا الاطفال نجت"
و تجدر الاشارة إلى ان هذا الحادث لم يكن فجرتها مسألة دينية. كانت القدس التي اتخذتها اعتداء بدلا من الاستسلام ، وخلال العصور الوسطى كان العرفي لسلب ونهب اي بلدة واذبح سكانها لمدة ثلاثة أيام وثلاث ليال في مثل هذه الحوادث. نفس حدثت في العديد من حالات اخرى ، مثل في القسطنطينيه في 1204 ؛ المدينة تم الاستيلاء عليه عنوة.